董玉飞自杀后，他的遗书被警方存留，而他的死因也成了谜，比较集中的说法有两个：

    第一，工作压力太大。作为农办主任，董玉飞负责的重建工作或许是难度最大的。他负责的重建房工程本来任务就很艰巨，9月24日发生的特大暴雨更是雪上加霜，不仅将以前的工作摧毁，还冲毁了许多其他农房，严重加大了他的工作难度。

    地震后一直在绵阳做心理援助的复旦大学心理学教授申荷永说，9月24日的特大暴雨很罕见，闪电和暴雷持续了18个小时，80％的北川县城被淹没，灾情达20年一遇，部分地区是50年一遇，造成的经济损失甚至超越了地震，这令农民们很生气，觉得原有的努力“白干了”。这种情况下，作为负责农业重建的主要官员，董玉飞产生很大的心理压力甚至抑郁情绪，是很容易理解的。

    此外，作为灾情最严重的地区，北川县的公务员们普遍一直处在高度紧张的工作状态，这会使得他们紧绷的精神无法得到放松和缓解。